Colombia alberga una notable diversidad biológica, ocupando el segundo lugar a nivel mundial en riqueza de plantas vasculares y vertebrados. Sin embargo, esta biodiversidad no se refleja en el conocimiento actual sobre los hongos del país.

A la fecha, el listado actual de los hongos y organismos afines (pseudohongos como oomicetes y mixomicetes) en Colombia comprende poco más de 7,500 especies, una cifra considerablemente menor en comparación con las 26,150 especies de plantas, 7,607 vertebrados y aproximadamente 68,000 insectos registrados.

Esta evidente subestimación de la diversidad fúngica se atribuye a la escasez de inventarios sistemáticos, estudios taxonómicos especializados y herramientas moleculares aplicadas a la micobiota nacional.

Aunque Colombia cuenta con ecosistemas altamente diversos y poco explorados, el país no figura entre los diez con mayor diversidad fúngica reportada a nivel global, quedando incluso por debajo de naciones en zonas templadas y con menor extensión territorial.

Las estimaciones actuales sugieren que la riqueza real de especies de Hongos en Colombia podría oscilar entre 27,430 y 380,000 especies, dependiendo del método de extrapolación empleado. Esta brecha de conocimiento representa un claro déficit Linneado (identidad taxonómica) y Darwiniano (relaciones evolutivas), limitando la comprensión del papel ecológico, biotecnológico y evolutivo de los hongos en los ecosistemas colombianos.