Colciencias define un grupo de investigación científica o tecnológica como el conjunto de personas que se reúnen para realizar investigación en una temática dada, formulan uno o varios problemas de su interés, trazan un plan estratégico de largo o mediano plazo para trabajar en él y producir unos resultados de conocimiento sobre el tema cuestión. Un grupo existe siempre y cuando demuestre producción de resultados tangibles y verificables, fruto de proyectos y otras actividades de investigación convenientemente expresadas en un plan de acción (proyectos) debidamente formalizado.

Actualmente, la facultad de ciencias cuenta con 9 departamentos que reúnen un total de 179 grupos de investigación, de los cuales 174 se encuentran activos y avalados por Colciencias. 

En concordancia con los fines misionales de la Universidad (docencia, investigación y extensión) la facultad de ciencias cuenta con 9 departamentos que reúnen un total de 199 laboratorios oficializados con funciones desde la dedicación exclusiva a la docencia hasta la oferta de servicios de extensión (cursos y alquiler de equipos). Entre estos se destacan los laboratorios acreditados "Análisis de Residuos de Plaguicidas-LARP" y "Extensión y Asesorías-LEA" del departamento de química y el laboratorio certificado "Laboratorio de Análisis Farmacéutico de la Universidad Nacional-LAFUN" del departamento de farmacia.